近日,国际著名期刊《International Journal of Biological Macromolecules》发表以球友会-千亿球友会·(中国)官方网站为第一完成单位,环境工程学院柴冉博士为第一作者的研究成果“Gene editing by SSB/CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein in bacteria”。《International Journal of Biological Macromolecules》是化学类中科院一区top期刊,影响因子IF:7.7。
Gene editing by SSB/CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein in bacteria(论文球友会-千亿球友会·(中国)官方网站)
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该研究采用SSB/CRISPR-Cas9 RNP非同源重组和同源重组基因编辑细菌的upp基因。将靶向upp基因的RNP和大肠杆菌的SSB一起转入大肠杆菌、假单胞菌和枯草芽孢杆菌原生质体,在含有5-FU的平板中长出的转化子均为非同源重组编辑转化子,基因编辑效率分别为9.75%、5.02% 和8.37%。将 RNP、SSB和同源臂长度为100 nt 的ssODN donor一起转入大肠杆菌、假单胞菌和枯草芽孢杆菌原生质体,在含有5-FU的平板中长出的转化子均为同源重组敲除upp转化子,基因编辑效率分别为45.11%、30.13%和27.18%。将 RNP、SSB和同源臂长度为100 bp 含有四环素抗性基因表达盒的双链DNA donor tetR-dsODN一起转入大肠杆菌、假单胞菌和枯草芽孢杆菌原生质体,在含有5-FU的平板中长出的转化子均为同源重组tetR替代upp的转化子,基因编辑效率分别为35.94%、22.46%和19.08%。结果表明,SSB/CRISPR-Cas9 RNP能够高效编辑细菌基因,简便、快捷、无需消除质粒。
柴冉博士是球友会-千亿球友会·(中国)官方网站2023年9月引进的高层次人才,长期致力于细菌基因编辑和微生物环境修复的研究工作。来校工作后在《Computers and Electronics in Agriculture》(中科院一区,IF:7.7)《Plant and Soil 》(中科院二区,IF:4.5)和《microorganisms》(中科院二区,IF:4.1)等国际著名期刊,以第一作者发表了4篇相关论文,展示其在生态环境修复领域的最新研究成果。
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论文连接:https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.135065